Κυρώθηκε από την Βουλή κατά πλειοψηφία (υπερψήφισαν ΝΔ και ΠΑΣΟΚ) πράξη νομοθετικού περιεχομένου από τις 13 Οκτωβρίου του 2009, με την οποία η Εθνική Υπηρεσία Πληροφοριών υπάγεται πλέον στον υπουργό Προστασίας του Πολίτη και όχι στο υπουργείο Εσωτερικών.

Ο Μ. Χρυσοχοϊδης τόνισε πως με την υπαγωγή αυτή υπηρετείται η ενιαία πολιτική ασφάλειας της χώρας από ένα ενιαίο υπουργείο και χαρακτήρισε κρίσιμο το να συνεργάζονται όλες οι υπηρεσίες μεταξύ τους.

Ο εισηγητής της ΝΔ, Γρ. Αποστολάκος, έδωσε θετική ψήφο αλλά παράλληλα επισήμανε την αλλαγή στάσης του ΠΑΣΟΚ ως κυβέρνησης, αφού ως αντιπολίτευση υπεραμύνονταν του ενιαίου υπουργείου Εσωτερικών και δήλωσε την ριζική διαφωνία με την πολιτική της κυβέρνησης. Ο κοινοβουλευτικός εκπρόσωπος της ΝΔ, Κ. Τζαβάρας διερωτήθηκε μήπως είναι η μεγάλη ιδέα που έχει αυτή η κυβέρνηση για τον εαυτό της που δημιουργεί προβλήματα αποτελεσματικότητας.

«Μη ξύνετε πληγές γιατί πέρυσι τέτοιο καιρό γλείφαμε τις πληγές μας από μια κατεστραμμένη Αθήνα. Προσπαθούμε να ανασυντάξουμε τις δυνάμεις, να ξαναδώσουμε την αίσθηση της ασφάλειας στον πολίτη, να δημιουργήσουμε συντεταγμένες υπηρεσίες» απάντησε ο κ. Χρυσοχοϊδης ενώ ο υφυπουργός Σπ. Βούγιας είπε ότι: «Η μόνη μεγάλη ιδέα είναι η καινούργια εικόνα για την Αστυνομία».

Ο Α. Σκυλλάκος εκ μέρους του ΚΚΕ δήλωσε την ανησυχία του για τον ρόλο της ΕΥΠ, διερωτήθηκε γιατί «ανακατεύεται» στα ζητήματα της αντιτρομοκρατικής. Όπως είπε οι κάμερες οι οποίες «θεωρήθηκαν το άλφα και το ωμέγα» για την ασφάλεια όχι μόνο δεν έκαναν τίποτα αλλά στρέφονται προς τους διαδηλωτές.

Από τον ΛΑΟΣ ο ειδικός αγορητής, Ιω. Κοραντής και ο κοινοβουλευτικός εκπρόσωπος, Α. Ροντούλης, ανέφερε ότι η ΕΥΠ πρέπει να υπαχθεί στον πρωθυπουργό, καθώς το εύρος των αρμοδιοτήτων της ΕΥΠ είναι πολύ μεγαλύτερο από κείνο του υπουργού Προστασίας του Πολίτη, ενώ είπε πως αυτό δεν έγινε για να παραμένει κάθε φορά στο απυρόβλητο.

Ο κοινοβουλευτικός εκπρόσωπος του ΣΥΡΙΖΑ, Φ. Κουβέλης, είπε ότι δεν συντρέχουν οι προϋποθέσεις του Συντάγματος περί έκτακτων, επειγουσών και απρόβλεπτων αναγκών για την σύνταξη νομοθετικής πράξης και έθεσε το ερώτημα τι χρειάζεται η ΕΥΠ όταν μια σειρά αρμοδιοτήτων της καλύπτονται από άλλες υπηρεσίες και ανέφερε ότι η διατήρηση της αποτελεί απόηχο ενός μακρινού παρελθόντος και πάντως ότι δεν δικαιολογούν οι συνθήκες την αυτοτέλεια της ΕΥΠ.

«Το κατεπείγον προέκυπτε από το γεγονός ότι δεν μπορούμε να αφήσουμε την ΕΥΠ σε ένα υπουργείο που δεν έχει σχέση, είναι τυπική υπαγωγή, δεν αλλάζει ο τρόπος λειτουργίας της ΕΥΠ», απάντησε ο Μ. Χρυσοχοΐδης και συμπλήρωσε «Δεν υπάρχει λόγος ανησυχίας σας λέω με βεβαιότητα ότι υπηρετείτε καλύτερα η εθνική ασφάλεια».

Τέλος, ο πρώην πρόεδρος της Βουλής, Απ. Κακλαμάνης πρότεινε να εκπονηθεί μια μελέτη για το αντικείμενο που πρέπει να υπηρετεί μια τέτοια και πρόσθεσε πως υπάρχει αναγκαιότητα μιας υπηρεσίας Αντικατασκοπείας που να υπάγεται στο υπουργείο Εθνικής Άμυνας και «για οποιαδήποτε άλλα ζητήματα θα πρέπει να υπάρχει μια υπηρεσία που θα υπάγεται στον έλεγχο της Βουλής».