Η εικόνα των ΗΠΑ για την κατάσταση στο εσωτερικό της ΝΔ μετά την παραίτηση του Κώστα Καραμανλή, τις υπερπτήσεις πάνω από το Αιγαίο, αλλά και τα κριτήρια που έθεσε η Ελλάδα προκειμένου να δεχτεί κρατούμενο του Γκουανάναμο αποκαλύπτουν απόρρητα τηλεγραφήματα της αμερικανικής πρεσβείας στην Αθήνα, που διέρρευσαν από το WikiLeaks και δημοσιεύει η εφημερίδα «Καθημερινή».

Στο τηλεγράφημα 07ATHENS638 περιγράφεται το αίτημα της αμερικανικής πρεσβεία στην Αθήνα τον Ιανουάριο του 2007 στο ελληνικό υπουργείο Εξωτερικών για να δεχθεί την μετεγκατάσταση ενός φυλακισμένου από το Γκουαντάναμο σε ελληνικό έδαφος. Σύμφωνα με το ίδιο τηλεγράφημα της Αμερικανικής πρεσβείας η τότε ΥΠΕΞ Ντόρα Μπακογιάννη, μέσω του Γενικού Γραμματέα του υπουργείου απαντά ότι θα ήθελε να απαντήσει «βοηθητικά» στο αμερικανικό αίτημα. Στο τέλος του τηλεγραφήματος ο Γενικός Γραμματέας λέει στον πρέσβη ότι «θα εξυπηρετούσε το ΥΠΕΞ αν το άτομο, που θα σταλεί, έχει παρουσιαστικό που θα δικαιολογούνταν στην Ελλάδα», δίνοντας ως παράδειγμα Αιγύπτιους ή Ουζμπέκους.

Μετά την εκλογική ήττα της ΝΔ στις εκλογές του Οκτωβρίου 2009, η αμερικανική πρεσβεία στην Αθήνα στέλνει το τηλεγράφημα 09ATHENS1587, στο οποίο περιγράφει πώς διαμορφώνεται το σκηνικό στη ΝΔ και ποιοι είναι οι νέοι υποψήφιοι για την προεδρία του κόμματος. Ο πρέσβης παρουσιάζει βιογραφικά στοιχεία και σχολιάζει τον Αντώνη Σαμαρά, την Ντόρα Μπακογιάννη, τον Δημήτρη Αβραμόπουλο και τον Παναγιώτη Ψωμιάδη.

Ένα ακόμη τηλεγράφημα – του State Department τον Ιούνιο του 2006 – ζητά από τις πρεσβείας των ΗΠΑ σε Αθήνα και Άγκυρα να προβούν σε διαβήματα προς τις αντίστοιχες αρχές Ελλάδας και Τουρκίας για τις υπερπτήσεις στο Αιγαίο και συγκεκριμένα πάνω από τα νησιά Αγαθονήσι και Φαρμακονήσι.

Οι Αμερικανοί φαίνεται να ανησυχούν ότι η ένταση στην περιοχή μπορεί να οδηγήσει σε μία «τραγωδία», ενώ θεωρούν ότι οι Ελληνικές αρχές προβαίνουν και αυτές σε προκλητικές ενέργειες. Ειδικά για το Αγαθονήσι και το Φαρμακονήσι, οι Αμερικανοί επισημαίνουν ότι ως συμμετέχων μέλος στη Συνθήκη Ειρήνης στο Παρίσι το 1947 οι ΗΠΑ έχουν αναγνωρίσει την ελληνική κυριαρχία στα εν λόγω νησιά.